Вот у меня если запущен торрент, и кто-то качает хотя бы со скоростью 3 Мб\с, то делать ничего практически нельзя, все в 3-4 раза медленее грузится и работает. Хотя вроде у ж/д диска скорость чтения до 75 мб/сек. Но это ведь линейная скорость? Получается нужен RAID, чтобы была нормальная работа на 2 потоках...
А сколько у Вас жестких дисков, уважаемый, и "висят" они на разных шлейфах? К тому же, не "висит-ли" на одном из шлейфов, параллельно с HDD, ещё и CD/DVD?
+ винты работают по какому интерфейсу?
к тому же, посмотрите в свойствах СД, какой стоит там режим: DMA или PIO. (не думаю, но все же)
Кстати, RAID не нужен, если я правильно догадываюсь в чем дело...